Source: REVUE DU PRATICIEN MEDECINE GENERALE
Auteur: Philippe Eveillard
Article paru le : 13 Mars 2007
CISMeF, le catalogue du CHU de Rouen, est l'outil de choix pour explorer intelligemment la Toile médicale francophone. Bénéficiant d´une indexation en grande partie « manuelle », CISMeF fournit des résultats en bonne adéquation avec vos requêtes. Si vous l´interrogez sur l´infarctus du myocarde, il ne vous affichera pas des documents sur la maladie de Crohn...
Si cette indexation est appréciable en termes d´adéquation des résultats, elle n´est pas sans inconvénients. Si vous souhaitez obtenir la meilleure adéquation possible, vous devez faire appel au même langage que celui utilisé par les documentalistes pour caractériser chaque document. C´est là que le bât blesse car ce langage, emprunté à celui de MEDLINE, est assez souvent éloigné du langage courant avec lequel vous « exploitez » Google. Cela vous oblige à entreprendre des procédures inhabituelles et contraires à votre goût immodéré pour le « lancer de mots clés » dans les fenêtres d´interrogation. Pour apprivoiser CISMeF, vous devez faire un effort d´adaptation à la syntaxe et au langage de l´outil. Cet effort n´est pas surhumain. Les quelques lignes qui suivent sont là pour vous convaincre que c´est relativement simple et qu´il suffit d´entrer dans la logique de l´affiliation descripteur/qualificatif pour s´en sortir.
Vous ne pouvez explorer CISMeF sans avoir assimilé dans votre esprit et intégré dans vos requêtes l´affiliation descripteur/ qualificatif. À la limite, c´est la seule notion que vous devez maîtriser, car le reste relève du détail.
Les 24 357 termes (descripteurs) du thésaurus MeSH servent à indexer les articles de la presse médicale internationale recensés dans MEDLINE. Leur version française est utilisée par les documentalistes du CHU de Rouen pour caractériser les documents hébergés par CISMeF.
Le langage MeSH ne se résume pas aux 24 357 descripteurs du thésaurus. Il faut aussi compter avec les 83 qualificatifs qui se marient volontiers aux descripteurs pour former un « couple » (ou une affiliation) descripteur/qualificatif.
Les qualificatifs ne se marient pas avec n´importe quel descripteur. Certains sont « promis » aux maladies, d´autres aux médicaments, d´autres enfin aux investigations diagnostiques ou aux procédures thérapeutiques.
Cela devient évident quand on prend conscience que le qualificatif « diagnostic » peut difficilement se joindre à autre chose qu´une maladie, que les « effets indésirables » portent une affection particulière aux médicaments et que le qualificatif « instrumentation » s´accorde bien avec les techniques chirurgicales.
Dans CISMeF, le module Terminologie est l´outil de recherche qui permet à la fois d´identifier le marié (le descripteur) et la mariée (le qualificatif) et de célébrer leur mariage. Pour montrer comment se déroule la cérémonie, la bonne idée est de prendre un exemple.
Vous recherchez des documents sur l´épidémiologie de la maladie de Horton. Dans le module Terminologie de CISMeF :
– vous entrez « Horton » dans la fenêtre « recherche » et cliquez sur « OK » ;
– vous cliquez sur l´intitulé « artérite temporale » qui vient d´apparaître dans le cadre « Horton » ; c´est le descripteur ;
– vous activez l´onglet « accès aux ressources » de la page relative à l´artérite temporale ;
– vous cochez la case « épidémiologie » (c´est le qualificatif) et cliquez sur le logo CISMeF.
Vous avez « marié » (affilié) épidémiologie et artérite temporale. Dans le bordereau d´indexation de chaque ressource affichée, vous trouverez l´affiliation artérite temporale/épidémiologie.
Le module Terminologie est le module de choix quand votre requête se limite à une affiliation descripteur/qualificatif (traitement de l´asthme, diagnostic de la polyarthrite rhumatoïde, complications de la maladie de Parkinson, effets indésirables des ß-bloquants, usage thérapeutique des hypocholestérolémiants...). Mais, dès que votre requête comporte 2 ou 3 descripteurs, ce module n´est plus opérationnel (sauf pour traduire vos mots clés du langage courant en descripteur MeSH). Dans ce cas, vous devez faire appel à un autre module de recherche. Le module de recherche avancée est le plus simple, celui de recherche booléenne le plus complet.
C´est celui que vous choisissez dans la majorité des cas, car il ne vous impose pas d´effort supplémentaire de syntaxe. Ce module se présente sous la forme d´un formulaire dont vous renseignez les fenêtres en fonction du nombre de descripteurs que vous souhaitez croiser. Ces descripteurs sont obtenus en sollicitant le module terminologie qui vous « accompagne » chaque fois que vous devez traduire vos mots clés en descripteurs MeSH.
Exemple avec une recherche sur « croissance et corticoïdes inhalés ».
Terminologie traduit « croissance » sans problème puisqu´il s´agit du même terme en langage MeSH. Les difficultés commencent avec « corticoïdes inhalés », car aucun descripteur ne rend compte de l´expression. Vous devez donc traduire séparément en langage MeSH « corticoïdes » et « inhalés », ce qui donne : « glucocorticoïdes » et « administration respiratoire ». Dans le formulaire du module de recherche avancée, vous entrez successivement :
– croissance dans la fenêtre « mot clé MeSH » ;
– glucocorticoïdes dans la première fenêtre « tous les champs» en sélectionnant « mot clé » dans le menu déroulant ;
– administration respiratoire dans la 2e fenêtre « tous les champs» en sélectionnant « mot clé » dans le menu déroulant. Un clic de souris sur « lancer la recherche » affiche une notice en parfaite adéquation avec la requête.
C´est le module de recherche « experte » de CISMeF. La syntaxe est plus complexe avec notamment l´introduction des notions de champ et d´opérateur booléen. J´ose à peine vous en parler, mais j´entends déjà certains d´entre vous qui m´interpellent avec des questions du type : « qu´est-ce qu´on fait quand on veut croiser 2 ou 3 affiliations descripteur/qualificatif ? ». Effectivement, dans ce cas de figure, vous ne pouvez ni solliciter le module terminologie, ni passer par le module de recherche avancée. Mais cette éventualité est exceptionnelle car, dans CISMeF, dès que vous multipliez les termes d´une requête (2 descripteurs + 2 qualificatifs = 4 termes), vous vous exposez au « silence ».
Exemple de formulation d´une équation dans le module de recherche booléenne.
Vous recherchez des documents permettant de répondre à la question : « dans le traitement de fond de l´asthme léger à modéré, est-il préférable de prescrire des corticoïdes inhalés ou des antileucotriènes ? ».
L´équation de recherche prend en compte :
– les affiliations asthme/traitement médicamenteux, glucocorticoïdes/ usage thérapeutique et antagonistes des leucotriènes/ usage thérapeutique ;
– le descripteur administration respiratoire ;
– les champs « mots clés » (.mc) pour les affiliations et le descripteur ;
– l´opérateur booléen AND pour croiser les différents membres de l´équation.
L´équation s´écrit : asthme/traitement médicamenteux.mc et glucocorticoïdes/usage thérapeutique.mc et administration respiratoire.mc et antagonistes des leucotriènes/usage thérapeutique. mc
Le catalogue du CHU de Rouen vous rend les plus grands services pour peu que vous acceptiez d´entrer dans sa logique de fonctionnement. Vous pouvez oublier le dernier exemple, car il est exceptionnel que CISMeF puisse répondre au croisement d´un grand nombre de termes. En réalité, CISMeF est d´autant plus performant que vous le sollicitez sur des thèmes médicaux généraux comme ceux qui sont représentés par une affiliation descripteur/qualificatif.
• Catalogue et index des sites médicaux francophones.
• Http://www.cismef.org
• Répertoire lancé en 1995 par le CHU de Rouen sous la houlette de Stefan Darmoni et Benoît Thirion.
• Rassemble 25 248 documents (le 7 février 2007) en provenance essentiellement des institutions de santé, des sociétés savantes et des facultés de médecine.
• Son contenu est indexé à l´aide des descripteurs du thésaurus MeSH. Le module Terminologie facilite la traduction des mots clés du langage courant en descripteurs MeSH.
• Bénéficie de nombreux modules de recherche :
– index alphabétique (pratique si un seul descripteur MeSH) ;
– recherche simple (avec interprétation de la requête en fonction de l´utilisation ou non du langage d´indexation) ;
– recherche avancée (avec son formulaire et ses nombreuses fenêtres) ;
– recherche booléenne (la plus experte) ;
– recherche pas à pas (la plus rigoureuse et la plus longue à mettre en oeuvre) ;
– accès aux ressources du module Terminologie (la référence...).
• Offre la possibilité d´étendre la recherche vers :
– PubMed, une des interfaces d´interrogation de MEDLINE ;
– NLM Gateway, une autre interface d´interrogation de MEDLINE ;
– Intute (ex OMNI), le catalogue anglophone ;
– Entrez, l´outil de recherche du National Center for Biotechnology Information ;
– Google (dans le cadre de Google co-op).
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